Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P20040 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P20040 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P20040 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P20040 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P20040 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P20040 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P20040 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P20040 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P20040 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P20040 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P20040 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P20040 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P20040 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P20040 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P20040 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P20040 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P20040 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P20040 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P20040 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P20040 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P20040 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P20040 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P20040 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P20040 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P20040 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P20040 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P20040 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P20040 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P20040 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P20040 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P20040 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P20040 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P20040 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P20040 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P20040 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P20040 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P20040 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P20040 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P20040 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P20040 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P20040 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P20040 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P20040 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P20040 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P20040 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P20040 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P20040 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P20040 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P20040 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P20040 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P20040 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P20040 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P20040 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P20040 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P20040 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P20040 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P20040 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P20040 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P20040 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P20040 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P20040 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P20040 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P20040 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P20040 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P20040 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P20040 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P20040 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P20040 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P20040 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P20040 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P20040 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P20040 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P20040 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P20040 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P20040 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P20040 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P20040 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P20040 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P20040 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P20040 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P20040 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P20040 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P20040 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P20040 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P20040 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P20040 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P20040 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P20040 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P20040 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P20040 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P20040 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P20040 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P20040 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P20040 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P20040 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P20040 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P20040 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P20040 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P20040 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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