Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NefhP19246 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NefhP19246 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NefhP19246 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NefhP19246 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NefhP19246 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NefhP19246 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NefhP19246 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NefhP19246 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NefhP19246 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NefhP19246 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NefhP19246 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NefhP19246 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NefhP19246 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NefhP19246 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NefhP19246 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NefhP19246 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NefhP19246 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NefhP19246 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NefhP19246 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NefhP19246 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NefhP19246 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NefhP19246 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NefhP19246 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NefhP19246 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NefhP19246 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NefhP19246 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NefhP19246 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NefhP19246 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NefhP19246 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NefhP19246 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NefhP19246 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NefhP19246 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NefhP19246 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NefhP19246 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NefhP19246 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NefhP19246 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NefhP19246 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NefhP19246 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NefhP19246 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NefhP19246 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NefhP19246 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NefhP19246 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NefhP19246 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NefhP19246 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NefhP19246 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NefhP19246 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NefhP19246 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NefhP19246 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NefhP19246 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NefhP19246 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NefhP19246 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NefhP19246 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NefhP19246 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NefhP19246 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NefhP19246 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NefhP19246 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NefhP19246 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NefhP19246 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NefhP19246 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NefhP19246 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NefhP19246 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NefhP19246 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NefhP19246 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NefhP19246 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NefhP19246 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NefhP19246 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NefhP19246 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NefhP19246 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NefhP19246 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NefhP19246 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NefhP19246 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NefhP19246 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NefhP19246 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NefhP19246 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NefhP19246 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NefhP19246 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NefhP19246 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NefhP19246 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NefhP19246 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NefhP19246 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NefhP19246 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NefhP19246 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NefhP19246 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NefhP19246 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NefhP19246 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NefhP19246 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NefhP19246 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NefhP19246 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NefhP19246 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NefhP19246 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NefhP19246 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NefhP19246 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NefhP19246 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NefhP19246 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NefhP19246 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NefhP19246 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NefhP19246 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NefhP19246 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NefhP19246 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms