Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-D1P14427 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-D1P14427 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms