Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nr4a1P12813 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nr4a1P12813 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms