Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FlgP11088 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FlgP11088 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FlgP11088 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FlgP11088 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FlgP11088 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FlgP11088 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FlgP11088 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FlgP11088 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FlgP11088 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FlgP11088 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FlgP11088 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FlgP11088 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FlgP11088 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FlgP11088 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FlgP11088 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FlgP11088 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FlgP11088 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FlgP11088 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FlgP11088 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FlgP11088 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FlgP11088 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FlgP11088 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FlgP11088 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FlgP11088 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FlgP11088 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FlgP11088 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FlgP11088 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FlgP11088 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FlgP11088 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FlgP11088 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FlgP11088 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FlgP11088 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FlgP11088 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FlgP11088 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FlgP11088 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FlgP11088 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FlgP11088 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FlgP11088 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FlgP11088 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FlgP11088 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FlgP11088 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FlgP11088 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FlgP11088 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FlgP11088 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FlgP11088 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FlgP11088 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FlgP11088 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FlgP11088 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FlgP11088 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FlgP11088 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FlgP11088 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FlgP11088 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FlgP11088 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FlgP11088 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FlgP11088 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FlgP11088 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FlgP11088 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FlgP11088 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FlgP11088 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FlgP11088 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FlgP11088 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FlgP11088 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FlgP11088 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FlgP11088 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FlgP11088 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FlgP11088 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FlgP11088 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FlgP11088 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FlgP11088 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FlgP11088 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FlgP11088 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FlgP11088 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FlgP11088 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FlgP11088 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FlgP11088 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FlgP11088 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FlgP11088 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FlgP11088 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FlgP11088 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FlgP11088 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FlgP11088 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FlgP11088 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FlgP11088 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FlgP11088 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FlgP11088 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FlgP11088 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FlgP11088 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FlgP11088 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FlgP11088 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FlgP11088 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FlgP11088 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FlgP11088 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FlgP11088 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FlgP11088 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FlgP11088 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FlgP11088 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FlgP11088 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FlgP11088 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FlgP11088 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms