Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dnmt3cP0DOY1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dnmt3cP0DOY1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms