Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Ndufb1P0DN34 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Ndufb1P0DN34 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Ndufb1P0DN34 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ndufb1P0DN34 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ndufb1P0DN34 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ndufb1P0DN34 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ndufb1P0DN34 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ndufb1P0DN34 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ndufb1P0DN34 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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