Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igsf6P0C6B7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms