Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01822 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01822 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01822 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01822 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01822 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01822 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01822 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01822 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01822 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01822 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01822 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01822 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01822 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01822 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01822 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01822 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01822 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01822 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01822 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01822 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01822 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01822 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01822 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01822 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01822 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01822 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01822 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01822 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01822 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01822 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01822 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01822 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01822 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01822 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01822 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01822 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01822 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01822 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01822 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01822 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01822 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01822 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01822 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01822 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01822 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01822 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01822 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01822 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01822 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01822 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01822 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01822 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01822 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01822 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01822 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01822 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01822 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01822 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01822 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01822 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01822 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01822 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01822 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01822 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01822 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01822 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01822 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01822 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01822 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01822 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01822 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01822 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01822 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01822 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01822 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01822 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01822 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01822 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01822 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01822 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01822 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01822 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01822 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01822 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01822 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01822 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01822 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01822 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01822 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01822 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01822 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01822 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01822 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01822 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01822 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01822 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01822 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01822 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01822 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms