Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01680 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01680 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01680 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01680 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01680 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01680 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01680 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01680 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01680 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01680 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01680 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01680 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01680 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01680 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01680 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01680 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01680 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01680 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01680 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01680 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01680 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01680 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01680 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01680 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01680 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01680 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01680 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01680 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01680 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01680 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01680 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01680 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01680 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01680 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01680 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01680 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01680 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01680 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01680 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01680 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01680 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01680 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01680 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01680 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01680 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01680 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01680 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01680 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01680 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01680 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01680 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01680 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01680 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01680 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01680 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01680 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01680 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01680 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01680 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01680 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01680 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01680 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01680 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01680 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01680 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01680 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01680 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01680 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01680 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01680 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01680 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01680 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01680 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01680 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01680 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01680 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01680 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01680 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01680 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01680 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01680 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01680 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01680 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01680 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01680 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01680 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01680 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01680 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01680 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01680 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01680 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01680 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01680 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01680 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01680 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01680 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01680 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01680 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01680 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138 ms