Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
P01649 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01649 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01649 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01649 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01649 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01649 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P01649 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01649 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01649 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01649 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01649 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01649 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01649 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P01649 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01649 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01649 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01649 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01649 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01649 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P01649 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01649 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01649 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01649 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01649 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01649 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P01649 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01649 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01649 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01649 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01649 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
P01649 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01649 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01649 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
P01649 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15□□□□□ -0.01
P01649 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
P01649 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
P01649 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01649 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01649 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P01649 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
P01649 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01649 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01649 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P01649 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01649 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01649 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01649 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01649 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01649 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01649 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01649 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01649 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01649 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01649 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01649 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01649 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01649 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01649 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01649 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01649 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P01649 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01649 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01649 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01649 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01649 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01649 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01649 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01649 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01649 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01649 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01649 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01649 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01649 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01649 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
P01649 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01649 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01649 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01649 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01649 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01649 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01649 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01649 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01649 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01649 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01649 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01649 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01649 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01649 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
P01649 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01649 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01649 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01649 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01649 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01649 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01649 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01649 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01649 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01649 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01649 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms