Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtatp6P00848 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtatp6P00848 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtatp6P00848 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtatp6P00848 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtatp6P00848 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms