Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Robo1O89026 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Robo1O89026 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Robo1O89026 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Robo1O89026 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Robo1O89026 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Robo1O89026 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Robo1O89026 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Robo1O89026 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms