Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
F11rO88792 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
F11rO88792 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
F11rO88792 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
F11rO88792 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
F11rO88792 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
F11rO88792 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
F11rO88792 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
F11rO88792 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
F11rO88792 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
F11rO88792 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
F11rO88792 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
F11rO88792 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
F11rO88792 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
F11rO88792 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
F11rO88792 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
F11rO88792 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
F11rO88792 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F11rO88792 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F11rO88792 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F11rO88792 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F11rO88792 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F11rO88792 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F11rO88792 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F11rO88792 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F11rO88792 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F11rO88792 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F11rO88792 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F11rO88792 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F11rO88792 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F11rO88792 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F11rO88792 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F11rO88792 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F11rO88792 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F11rO88792 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F11rO88792 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F11rO88792 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F11rO88792 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F11rO88792 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
F11rO88792 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
F11rO88792 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F11rO88792 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F11rO88792 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
F11rO88792 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F11rO88792 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F11rO88792 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F11rO88792 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F11rO88792 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F11rO88792 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F11rO88792 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms