Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnmt3bO88509 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnmt3bO88509 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms