Protein–RNA interactions for Protein: O88324

Cd83, CD83 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd83O88324 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd83O88324 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd83O88324 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd83O88324 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd83O88324 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd83O88324 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms