Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfdp1O88271 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms