Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrna4O70174 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms