Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ChkbO55229 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChkbO55229 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ChkbO55229 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChkbO55229 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ChkbO55229 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms