Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
OtogO55225 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
OtogO55225 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
OtogO55225 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
OtogO55225 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
OtogO55225 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
OtogO55225 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
OtogO55225 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
OtogO55225 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtogO55225 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtogO55225 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtogO55225 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtogO55225 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtogO55225 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtogO55225 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtogO55225 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtogO55225 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtogO55225 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtogO55225 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
OtogO55225 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtogO55225 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtogO55225 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtogO55225 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtogO55225 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
OtogO55225 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtogO55225 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtogO55225 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtogO55225 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtogO55225 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtogO55225 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtogO55225 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtogO55225 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtogO55225 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtogO55225 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtogO55225 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtogO55225 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtogO55225 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtogO55225 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtogO55225 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
OtogO55225 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtogO55225 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtogO55225 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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OtogO55225 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtogO55225 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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OtogO55225 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtogO55225 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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OtogO55225 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtogO55225 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtogO55225 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtogO55225 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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OtogO55225 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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OtogO55225 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtogO55225 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtogO55225 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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OtogO55225 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtogO55225 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtogO55225 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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OtogO55225 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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OtogO55225 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtogO55225 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtogO55225 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtogO55225 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtogO55225 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtogO55225 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtogO55225 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtogO55225 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtogO55225 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
OtogO55225 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtogO55225 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtogO55225 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtogO55225 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtogO55225 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtogO55225 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtogO55225 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtogO55225 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtogO55225 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtogO55225 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtogO55225 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtogO55225 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtogO55225 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtogO55225 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtogO55225 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
OtogO55225 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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