Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DffaO54786 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DffaO54786 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DffaO54786 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DffaO54786 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DffaO54786 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DffaO54786 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DffaO54786 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DffaO54786 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DffaO54786 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DffaO54786 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DffaO54786 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DffaO54786 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DffaO54786 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DffaO54786 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DffaO54786 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DffaO54786 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DffaO54786 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DffaO54786 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DffaO54786 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DffaO54786 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DffaO54786 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DffaO54786 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DffaO54786 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DffaO54786 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DffaO54786 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DffaO54786 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DffaO54786 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DffaO54786 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DffaO54786 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DffaO54786 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DffaO54786 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DffaO54786 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DffaO54786 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DffaO54786 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DffaO54786 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DffaO54786 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DffaO54786 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DffaO54786 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DffaO54786 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DffaO54786 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DffaO54786 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
DffaO54786 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DffaO54786 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DffaO54786 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DffaO54786 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DffaO54786 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DffaO54786 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DffaO54786 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
DffaO54786 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
DffaO54786 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DffaO54786 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DffaO54786 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DffaO54786 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DffaO54786 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DffaO54786 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DffaO54786 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DffaO54786 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DffaO54786 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DffaO54786 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DffaO54786 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DffaO54786 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DffaO54786 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DffaO54786 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DffaO54786 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DffaO54786 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DffaO54786 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DffaO54786 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DffaO54786 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DffaO54786 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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DffaO54786 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DffaO54786 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DffaO54786 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DffaO54786 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DffaO54786 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DffaO54786 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DffaO54786 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DffaO54786 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DffaO54786 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DffaO54786 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DffaO54786 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DffaO54786 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DffaO54786 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DffaO54786 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DffaO54786 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DffaO54786 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DffaO54786 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DffaO54786 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DffaO54786 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DffaO54786 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DffaO54786 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DffaO54786 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DffaO54786 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DffaO54786 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DffaO54786 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DffaO54786 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DffaO54786 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DffaO54786 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms