Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TnxbO35452 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TnxbO35452 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TnxbO35452 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TnxbO35452 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TnxbO35452 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TnxbO35452 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TnxbO35452 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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TnxbO35452 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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TnxbO35452 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnxbO35452 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnxbO35452 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnxbO35452 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms