Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nedd9O35177 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Nedd9O35177 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Nedd9O35177 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Nedd9O35177 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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Nedd9O35177 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Nedd9O35177 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Nedd9O35177 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Nedd9O35177 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nedd9O35177 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Nedd9O35177 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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