Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Polr1aO35134 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Polr1aO35134 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr1aO35134 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms