Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cnih2O35089 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih2O35089 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms