Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl4M0QW46 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl4M0QW46 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl4M0QW46 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl4M0QW46 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl4M0QW46 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl4M0QW46 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl4M0QW46 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ascl4M0QW46 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ascl4M0QW46 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ascl4M0QW46 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms