Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8356J3QPD3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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