Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm2035J3QP87 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Gm2035J3QP87 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Gm2035J3QP87 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Gm2035J3QP87 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Gm2035J3QP87 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Gm2035J3QP87 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Gm2035J3QP87 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gm2035J3QP87 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2035J3QP87 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms