Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5294J3QP53 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5294J3QP53 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5294J3QP53 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5294J3QP53 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5294J3QP53 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5294J3QP53 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5294J3QP53 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5294J3QP53 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5294J3QP53 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5294J3QP53 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5294J3QP53 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5294J3QP53 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5294J3QP53 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5294J3QP53 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5294J3QP53 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5294J3QP53 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5294J3QP53 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5294J3QP53 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5294J3QP53 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5294J3QP53 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5294J3QP53 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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