Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp616J3QN14 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp616J3QN14 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp616J3QN14 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp616J3QN14 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp616J3QN14 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp616J3QN14 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp616J3QN14 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp616J3QN14 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp616J3QN14 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp616J3QN14 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms