Protein–RNA interactions for Protein: J3QME2

Gm20914, Predicted gene, 20914, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20914J3QME2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20914J3QME2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20914J3QME2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20914J3QME2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20914J3QME2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20914J3QME2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20914J3QME2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20914J3QME2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20914J3QME2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20914J3QME2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms