Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21897J3KMP5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm21897J3KMP5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm21897J3KMP5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm21897J3KMP5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21897J3KMP5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21897J3KMP5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21897J3KMP5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21897J3KMP5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21897J3KMP5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21897J3KMP5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21897J3KMP5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21897J3KMP5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21897J3KMP5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21897J3KMP5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21897J3KMP5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21897J3KMP5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21897J3KMP5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21897J3KMP5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21897J3KMP5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms