Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AK157302I3ITR1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms