Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20696H3BJN7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms