Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Taf4bG5E8Z2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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