Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp32F8VPZ3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp32F8VPZ3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms