Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Farp1F8VPU2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Farp1F8VPU2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms