Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
D430041D05RikF6ZGR6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
D430041D05RikF6ZGR6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms