Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Crocc2F6XLV1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Crocc2F6XLV1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms