Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf165E9QAU8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf165E9QAU8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf165E9QAU8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf165E9QAU8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms