Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdzd7E9Q9W7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdzd7E9Q9W7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdzd7E9Q9W7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd7E9Q9W7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms