Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col22a1E9Q7P1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col22a1E9Q7P1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col22a1E9Q7P1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms