Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtproE9Q612 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtproE9Q612 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms