Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4E0

5031410I06Rik, RIKEN cDNA 5031410I06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5031410I06RikE9Q4E0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
5031410I06RikE9Q4E0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
5031410I06RikE9Q4E0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms