Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3G8

Nup153, Nucleoporin 153, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup153E9Q3G8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup153E9Q3G8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup153E9Q3G8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup153E9Q3G8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms