Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tarbp1E9Q368 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tarbp1E9Q368 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms