Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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