Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3893E9Q1I1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
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Gm3893E9Q1I1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Gm3893E9Q1I1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Gm3893E9Q1I1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Gm3893E9Q1I1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Gm3893E9Q1I1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Gm3893E9Q1I1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Gm3893E9Q1I1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Gm3893E9Q1I1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Gm3893E9Q1I1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Gm3893E9Q1I1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Gm3893E9Q1I1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm3893E9Q1I1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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