Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610021A01RikE9Q0Q3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms