Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4930426L09RikE9Q0N7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms